Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef17A2ASJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef17A2ASJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms