Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn3aA2ASI5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn3aA2ASI5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms