Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn1aA2APX8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms