Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ambra1A2AH22 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ambra1A2AH22 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms