Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34dA2AGU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34dA2AGU5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms