Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmpd4A2AFR3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms