Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyb561d1A2AE42 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyb561d1A2AE42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms