Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87977A2A958 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87977A2A958 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87977A2A958 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87977A2A958 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87977A2A958 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87977A2A958 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87977A2A958 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms