Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chd5A2A8L1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd5A2A8L1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms