Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpatch8A2A6A1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gpatch8A2A6A1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Gpatch8A2A6A1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gpatch8A2A6A1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gpatch8A2A6A1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Gpatch8A2A6A1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gpatch8A2A6A1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms