Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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