Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4921501E09RikA0A0R4J054 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms