Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ighv1-18A0A0A6YXN4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms