Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BC034090A0A087WP46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC034090A0A087WP46 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC034090A0A087WP46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms