Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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