Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vstm4T1NXB5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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