Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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