Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CcniQ9Z2V9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms