Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdpk1Q9Z2A0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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