Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl8Q9Z121 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl8Q9Z121 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms