Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psma4Q9R1P0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma4Q9R1P0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms