Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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