Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms