Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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