Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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