Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms