Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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SacsQ9JLC8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SacsQ9JLC8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms