Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin3Q9JLB9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms