Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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