Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl39Q9JKF7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms