Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms