Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms