Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clstn2Q9ER65 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.7 ms