Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmgn3Q9DCB1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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