Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms