Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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