Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms