Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Med27Q9DB40 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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