Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms