Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D4W2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms