Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2al3Q9D4U4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2al3Q9D4U4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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