Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Syce1Q9D495 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Syce1Q9D495 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Syce1Q9D495 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Syce1Q9D495 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce1Q9D495 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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