Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rufy3Q9D394 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rufy3Q9D394 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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