Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt20Q9D312 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms