Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms