Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms