Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms