Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdhd3Q9CYW4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms