Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms