Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd4Q9CWX4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rpusd4Q9CWX4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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